Ботанический сад Тартуского Университета был основан в 1803 году на месте современного парка на улице Тийги. Основателем ботанического сада и его первым управляющим был профессор Г. А. Германн. Он перенес сад на его нынешнее место, где когда-то у старой городской стены располагался вал бастиона. Руководил строительными работами и занимался планировкой сада главный садовник И. А. Вейнманн. Главные черты его замысла сохранились и по сей день. В 1811 году директором ботанического сада был избран профессор естествознания К. Ф. Ледебур, добросовестно исполнявший возложенные на него обязанности в течение двадцати пяти лет. Благодаря его энергии и энтузиазму сад разрастался и достиг сегодняшних размеров (3,5 га). Была построена первая оранжерея для тропических растений, организовано множество экспедиций. В последующие годы здесь работали такие известные ботаники как Э. Р. Траутветтер, К. И. Максимович, А. Г. Бунге, Т. Липпмаа. Мемориальные плиты на стене здания Института ботаники и экологии, а также памятники в парке хранят память о них. Источник Посмотреть вложение 223453 Посмотреть вложение 223459 Посмотреть вложение 223478 Посмотреть вложение 223480
Если заходить в ботанический сад со стороны реки Эмайыги, по правую сторону остается молодой сад клематисов. Коллекция состоит из 44 крупноцветковых сортов, выведенных в Эстонии и цветущих на побегах текущего года. Большинство из представленных гибридов были выведены семьей Кивистик, а также частично — селекционером Эйно Кала. Их цветовая гамма варьируется от белого до темно-красного. Цветение клематисов можно наблюдать с конца июля и до самых заморозков.
Розарий расположен в восточном углу сада, ближе к реке Эмайыги. Он привлекает посетителей яркой палитрой красок и впечатляющим букетом ароматов во время их массового цветения, приходящегося на июль-август. В розарии представлено около 250 сортов роз.
В пальмовой оранжерее(сейчас она на реконструкции) растет 58 видов пальм. Старейшая пальма — 90-летняя канарская финиковая пальма. Самая высокая — вашингтония нитевидная (Washingtonia filifera, 20 м), растущая в средней части оранжереи. В субтропической оранжерее представлены растения со всех континентов субтропического пояса. На первой и второй клумбах оказались представители флоры австралийского материка.
Альпинарий находится в центре сада в ложбине и на склонах бывшего бастиона Св. Георгия. Большинство растений альпинария родом с верхней границы лесного пояса и альпийских горных лугов.